即使經過深層清潔耐藥性醫院細菌仍然存在

科學家利用基因組測序揭示了一種耐藥性胃腸道細菌在醫院內的傳播程度，突顯了醫院在控制感染方面面臨的挑戰。糞腸球菌是常見于胃腸道中的一種細菌，通常存在于其中而不會引起宿主問題。但是，在免疫功能低下的患者中，它可能導致威脅生命的感染。

在過去的三十年中，出現了對包括氨芐青霉素和萬古霉素在內的一線抗生素具有耐藥性的菌株，限制了治療選擇，尤其令人擔憂的是，這些菌株通常是在醫院獲得的糞腸球菌感染中發現的。

劍橋大學和倫敦衛生與熱帶醫學學院的一組科學家率先采用了一種將流行病學和基因組信息相結合的方法，以繪制細菌在醫療機構中的傳播情況。這有助于醫院識別感染源并告知感染控制措施。

在發表于《自然微生物學》上的一項研究中，研究小組將該技術應用于耐藥性大腸埃希菌在醫院中的傳播。

劍橋大學醫學系的Theodore Gouliouris博士是該研究的第一作者，他說：“二十多年來，我們已經知道醫院的患者可以感染并傳播耐藥的糞腸球菌。它的傳播要求我們了解細菌在哪里-它的“水庫”-以及如何傳播。

“迄今為止，大多數研究都依賴于從樣品中培養細菌。但是，正如我們已經表明的那樣，全基因組測序-查看細菌的DNA-結合詳細的患者和環境采樣可以是幫助我們繪制其細菌圖的強大工具。傳播并提供預防進一步爆發的方法。”

該團隊追蹤了六個月內入院至劍橋大學醫院NHS基金會信托基金Addenbrooke醫院的149名血液學患者。他們從患者的糞便樣本和醫院環境的拭子中取樣，并進行糞便大腸桿菌培養。

細菌的基因組分析在鑒定醫院獲得的糞便中更為有效：在101名可以接受隨訪的患者中，基因組分析確定三分之二的患者患有糞便，而僅使用培養方法的患者不到一半。

從醫院環境中抽取的拭子中近一半(48%)對耐萬古霉素的糞腸球菌呈陽性。其中包括36%的醫療設備，76%的非接觸區域(如通風孔)，41%的床位和68%的公共浴室。